甘蔗最大的威胁来自于甘蔗病害。病害一经发生，即使用药剂防治，收效亦不理想，因病原入侵组织内部，致使甘蔗首先在生理上、组织上和形态上发生病理变化，然后才表现各种病症，而大多数杀菌剂无法进入甘蔗组织内部发挥作用。因此，甘蔗病害的防治应坚持“预防为主，综合防治”的原则，旨在消除一切有利于病原生长、发育、繁殖、传播、致病等因素，用生物、物理、化学、机械的方法防治病害，使甘蔗病害受到最大限度的控制。
凤梨病
发病症状：
凤梨病属真菌性病害，主要侵染甘蔗种苗，使其不能萌发而造成严重损失。由留存在土壤中的病菌或感病种苗及其他感病寄主传播。经种苗两端切口侵入，之后在薄壁组织间迅速蔓延。感病初期种苗切口呈红色，并散发凤梨香味，继而中心薄壁组织被破坏，其内部变空，呈黑色。轻度感病，虽可萌发生长，但生长势弱，病情发展到一定程度，植株死亡。低温、高湿，长期阴雨天气或过于干旱等不利于蔗苗萌发的因素，均可诱使本病发生。
甘蔗凤梨病 防治方法：
1、选种抗病品种：如粤糖64-395、华南56-12等;
2、选苗：选用无病健壮蔗苗、梢头苗等作种;
3、掌握下种适期，冬植、早春植蔗采用地膜覆盖;
4、种苗消毒、浸种处理：用50%多菌灵或托布津各1000倍液浸种10分钟;或将种苗剥荚后用2%石灰水浸种12-24小时，或用清水浸种1-2天。
5、秋植采种及早春收砍宿根容易发生凤梨病引起败蔸，用2%石灰水或多菌灵、托布津1000倍液喷淋蔗桩
6、实行水旱轮作。
赤腐病
发病症状：
赤腐病属于真菌性病害。主要为害蔗茎及叶片中脉。被害茎早期外表无任何症状，茎纵剖时，可见蔗肉红色，中部夹杂与蔗茎垂直的白色圆形或长形斑块，发出淀粉发酵的酸味，受害蔗叶中脉初期呈鲜红色小点，迅速扩展为纺锤形，叶中央枯死成灰白色或秆黄色，边缘呈暗红色。病菌适宜生长温度为27℃。通过螟害孔、生长裂缝等入侵。 甘蔗赤腐病 防治方法：
1、选用抗病品种;
2、在52°C温水中加50%苯莱特1500倍悬浮液浸种20-30分钟，或用52°C温水浸后再浸入0.2%-0.3%有机汞剂中2-3分钟;
3、及时消灭螟虫;
4、甘蔗收获后，及时将病株、病叶烧毁。
黑穗病
发病症状：
黑穗病属真菌性病害。以蔗茎顶端部生长出一条黑色鞭状物(黑穗)为明显特征，其黑穗短者笔直，长者或卷曲或弯曲，无分枝。感病蔗种萌发较早，蔗株生长纤弱。叶片狭长，色淡绿，节间短。宿根蔗、分蘖茎和干旱、瘦瘠而管理差的蔗田发病较多。高温高湿，雨季或蔗田积水，旱后较多雨等，为本病发生的有利条件。传播媒介主要是气流。 甘蔗黑穗病 防治方法：
1、选用抗病品种;
2、种苗消毒：用0.5%甲氧乙氯汞浸种5分钟，或用50-52°C温水浸种20分钟;
3、适当多施磷钾肥料以促使甘蔗早生快发;
4、发现病株及时拔除并集中烧毁;
5、实行轮作，发病区不留宿根;
6、不在发病区采苗。
白叶病、崁纹病、叶枯病等。只要得了病，不管是什么病，一律无药可医，只能整株拔除，烧掉，再好好祷告，祈盼不会传染开来，这就需要勤快巡查，早期发现，迅速扑灭。而更好的防治方法是育成抗病品种，不怕病害来袭。
