乙肝病毒是否感染人体并导致肝炎，不仅取决于乙肝病毒，更重要的是取决于人体免疫系统对乙肝病毒的反应。如果没有药物等外部作用，一般会经历四个阶段。
第1阶段：免疫耐受阶段。
乙肝病毒感染人体后，主要生活在肝细胞内。在这一阶段，乙肝病毒主要在肝细胞中生存，而肝细胞中的乙肝病毒则主要在肝脏中生存。"我们要做的，就是让乙肝病毒在肝脏中生存。他说："我是一个很有爱心的人，我希望我的孩子们都能健康成长。
乙肝病毒携带者处于这种免疫耐受状态。
第二阶段：免疫清除阶段。
乙肝病毒在体内潜伏一段时间后（潜伏期因人而异），我们的免疫监视系统会慢慢发现这个 "敌人 "并启动免疫反应，产生免疫细胞和抗体。这些抗体识别乙肝病毒的抗原并与之结合，形成免疫复合物。这些免疫复合物被体内的吞噬细胞吞噬，然后排泄到细胞外。
我们可以把肝细胞想象成一间房子，乙肝病毒是一群潜入的小偷，人体的免疫系统是房子里的监视器，而免疫物质是警察。当监控系统发出警报时，一群警察从房子的各个方向赶来。当警察和小偷打架时，房子里的门窗和家具就很容易被打破。
所以，处于免疫清除阶段的肝细胞有炎症反应，因为病毒和免疫系统在 "打架"，把肝细胞搞得一团糟。肝细胞被 "打伤"，出现了炎症反应。此时，肝细胞的细胞膜通透性发生变化，甚至受损，细胞内的转氨酶进入血液。肝功能检查将显示血清转氨酶显著增加（也称为ALT水平升高），这是肝炎可能已经发生的迹象，携带者可能正在发展乙型肝炎，这时应考虑抗病毒治疗。这时应考虑进行抗病毒治疗。
第3阶段：不活动期。
经过激烈的战斗，部分乙肝病毒将被免疫系统清除，或者通过积极的药物治疗清除病毒。我所说的病毒清除是指血液中不再能检测到乙肝病毒的DNA，但一些病毒可能仍然留在肝脏中。在这个时期，乙肝病毒没有活性，它的复制能力受到抑制，病毒水平很低，所以暂时不会掀起波澜。
第四阶段：反应期。
处于非活跃期的患者在某些诱因下可能会再次变得活跃，如免疫力下降或化疗，肝脏可能再次出现炎症反应，也就是说，肝炎再次发作。
换句话说，处于第二和第四阶段的乙肝病毒感染者是需要治疗肝炎的人，而处于第一和第三阶段的人暂时不需要治疗，只要定期复查，按时监测他们的乙肝病毒和肝脏。
