世界卫生组织建议，只要没有抗病毒治疗的禁忌症，所有丙型肝炎病毒复制（HCV RNA阳性）的HCV感染者都应考虑接受标准化的抗病毒治疗，无论他们是否出现肝功能异常；有明显肝脏纤维化的患者应立即开始治疗。
世界卫生组织推荐的HCV感染者的治疗程序：
丙型肝炎是可以治愈的。丙型肝炎治疗的目标有两个：第一，清除丙型肝炎病毒，改善肝脏疾病，防止和减少肝硬化和肝癌的发展。二是减少丙型肝炎的继续传播。
丙型肝炎病毒感染者的治疗越早，效果越好，90%以上能完全清除病毒，彻底治愈疾病；肝脏明显纤维化或已经形成肝硬化的患者，可以阻止或延缓肝病的继续发展，减少失代偿期肝硬化和和肝细胞癌的发生，降低与丙型肝炎直接或间接有关的死亡率。治愈后的丙型肝炎病毒感染者就不再具有传染性，减少了丙型肝炎病毒的传播。
丙型肝炎的标准治疗是干扰素+利巴韦林。对于干扰素+利巴韦林治疗失败或不能耐受的患者，可以使用较新的一代直接抗病毒药物。这些新一代的直接抗病毒药物已经在国外许多国家和地区上市，在中国的临床试验正在进行中，不久将在中国上市。经过规范的抗病毒治疗，90%以上的丙型肝炎病毒感染者可以被治愈。治疗前应评估丙肝的疾病发展阶段和病毒的基因型，并在医生的指导下选择抗病毒治疗方案；治疗期间应定期到医院复查，评估药物的疗效，监测药物的毒性。
