1.遗传因素
目前研究表明抽动障碍与遗传因素有关，但遗传方式尚不明确，抽动障碍的病因可能为常染色体显性遗传，外显率受多种因素的影响而不全。此外，在一些家庭中，Tourette综合征、其他类型的抽动障碍及强迫症间存在一定的联系，因此，提示Tourette综合征、其他类型的抽动障碍、强迫症可能为共同的遗传易患病性(易感性)的不同表达。
2.神经生化因素
抽动障碍与神经生化因素之间的关系非常复杂，且尚无最后定论。抽动障碍患儿可能存在以下异常：①多巴胺活动过度或受体超敏;②苍白球等部位谷氨酸水平增高;③去甲肾上腺素功能失调;④5-羟色胺水平降低;⑤乙酰胆碱不足，活性降低;⑥r氨基丁酸抑制功能降低;⑦基底节和下丘脑强啡肽功能障碍。目前，最受关注的是兴奋性氨基酸，如谷氨酸和多巴胺系统间相互作用的异常。
3.脑器质性因素
约50%～60%的该障碍患儿存在非特异脑电图异常;少数患儿存在头颅CT的异常，如脑萎缩;部分患儿存在左侧基底节缩小及胼胝体减小，提示抽动障碍患儿可能存在皮质一纹状体一丘脑一皮质通路的异常和脑的侧化异常;PET研究提示患儿存在双侧基底节、额叶皮质、颞叶的代谢过度。
4.社会心理因素
应激可诱发有遗传易感性的个体发生该障碍。
5.其他
有研究报道该障碍可能与β溶血性链球菌感染引起的自身免疫有关。药物(中枢兴奋剂、抗精神病药)也可诱发抽动障碍。
