1.无菌性脑膜炎、脑膜脑炎、脑炎：是一种常见的并发症，在上海医科大学附属儿科医院报告的腮腺炎各种并发症中，脑膜脑炎占94.08%。它特别发生于小儿患者，男孩多于女孩。腮腺炎期间脑炎的发病率约为0.3%至8.2%。由于不能对所有流行性腮腺炎患者进行脑脊液检查，而且在一些病例中从未见到腮腺肿大，因此很难计算出确切的发病率。脑膜脑炎的症状最早可在腮腺肿大前6天或在腮腺肿大后2周出现，一般倾向于在肿大后1周内出现。急性脑水肿的表现如头痛和呕吐更为明显。预后良好，但个别脑炎病例可能导致死亡。25%-50%的病例可能没有腮腺肿大。腮腺肿大是一种常见的脑部疾病，其发病率较高，但也有部分病例是由于脑膜炎引起的，因此，在临床上，腮腺肿大是一种常见的脑部疾病。
2.多发性神经炎、脊髓灰质炎等：偶有多发性神经炎和脊髓灰质炎在腮腺炎后1～3周出现，预后大多良好。肿大的腮腺可能压迫面神经引起暂时性面神经麻痹。有时会出现平衡失调、三叉神经炎、半身不遂、截瘫和上升性瘫痪。偶尔也会因腮腺炎后导管变窄而并发脑积水。
3.耳聋：由听觉神经受累引起。虽然发病率很低（约1/15,000），但可成为永久性完全耳聋；幸运的是，75%的耳聋只发生在一只耳朵。
