肝内胆管结石的产生与人类现代生活习惯以及饮食习惯都是分不开的，也就是说，肝内胆管结石并不会无缘无故砸到你的头上，而是完全由自己导致的。具体肝内胆管结石的形成原因主要有以下几点：
1、胆汁淤滞胆汁动力学的改变：由于胆管狭窄胆道梗阻或胆管囊状扩张，继之发生胆汁动力学改变涡流、淤滞和细菌感染。游离胆红素沉淀，黏液脓性物的参与，形成褐黄色胆泥，进一步加重胆道梗阻，淤滞、感染，促使胆石的形成。
2、胆道感染与肝胆管结石：普遍认为胆道感染，特别是大肠埃希杆菌感染，产生细菌源β-葡萄糖醛酸酶，使结合胆红素水解为游离胆红素。在胆道感染时胆管炎性黏液物质增加凝聚作用增强，加以有钙离子等金属离子的参与，形成以胆红素钙为主的胆管结石。
3、低蛋白与肝胆管结石：低蛋白高碳水化合物饮食，β-葡萄糖醛酸酶抑制物葡萄糖二酸1-4内酯的含量减少，有利于β-葡萄糖醛酸酶使结合胆红素水解为游离胆红素，不溶于水，容易发生沉淀，是形成结石的基础。饮食结构与肝胆管结石的形成有关，这在发展中国家肝胆管结石发病率较高，可能是其中的原因之一。
