焦虑障碍患者常常表现为各种精神性焦虑症状或躯体性焦虑症状(心血管系统、呼吸系统、自主神经系统等)，并与多种躯体疾病共患，常就诊于综合医院。而且各种躯体疾病患者，有很高的风险继发焦虑谱系障碍。因此对于综合医院焦虑障碍患者的治疗，治疗目标、原则和策略需要按照焦虑障碍防治指南的推荐和建议。
轻度焦虑障碍患者可以选择心理治疗，中重度焦虑障碍患者，则需要考虑药物治疗或者药物治疗联合心理治疗。但是在综合医院的焦虑障碍患者其药物治疗，还需要考虑到患者共患的躯体疾病、服用的治疗药物，以及患者个体化特征(如年龄、躯体状况等)对焦虑障碍疾病以及抗焦虑药物疗效的影响。
综合医院焦虑障碍患者的药物治疗，同样需要尽早开始治疗，治疗的主要目标是减轻焦虑的症状，减少残疾和痛苦，并且对躯体疾病的治疗有帮助，能够改善患者健康相关的生活质量。
一些神经生物学、神经发育和社会心理因素影响着焦虑障碍的发生发展，因此选择治疗药物前，评估患者躯体状况、个性特征、负性生活事件以及所接受的治疗药物，尽可能首选最佳疗效和最少不良反应的治疗，治疗前需要评估患者是否愿意接受其他药物治疗(如心理治疗)。
其次重要的是在处方治疗药物前，医生应该注意治疗焦虑的药物可能和这些治疗躯体疾病的药物间的相互作用(包括药代动力学过程和药效动力学过程相互作用)。此外，一些心理治疗有助于改善焦虑障碍患者的症状，如认知行为治疗技术也可以改善躯体疾病患者的负性知觉，以及这些负性知觉对患者造成的影响，因为这些负性知觉常常会使焦虑障碍恶化。
在评估基础上，联合适当的心理治疗策略，可以显著改善患者的预后。此外，在综合医院治疗焦虑障碍患者，某些情况下，需要转诊患者到精神专科医院寻求专业的帮助。
焦虑障碍也是老年个体中常见的精神障碍，老年焦虑障碍患者，因为其特殊的躯体状况，接受抗焦虑药物治疗也具有一定的特殊性，治疗中有相应的注意事项。
