1.痛经
痛经是子宫内膜异位症最典型的症状。可以发生在月经前、月经时及月经后。严重阶段疼痛难忍，止痛剂加量甚至无效。疼痛由于子宫内膜异位症内部出血刺激局部组织炎性反应引起。子宫内膜异位症病灶分泌前列腺素增加，导致子宫肌肉挛缩，痛经势必更为显著。月经过后，出血停止，疼痛缓解。
2.月经异常
可以表现为月经过多或者周期紊乱。造成月经异常多数与子宫内膜异位症影响卵巢功能有关。子宫内膜异位症患者可以发生卵巢功能失调，如排卵异常等。
3.不孕
子宫内膜异位症患者常伴有不孕。原因：子宫内膜异位症常可引起输卵管周围粘连影响卵母细胞捡拾;或因卵巢病变影响排卵。
4.性交疼痛
子宫直肠窝、阴道直肠隔的子宫内膜异位症可以引起性交痛(深部触痛)，经期排便次数增加、疼痛(里急后重)。
5.其他
膀胱刺激征：子宫内膜异位至膀胱者，出现有周期性尿频、尿痛、血尿。腹壁瘢痕及脐部的子宫内膜异位症则出现周期性局部肿块及疼痛。
