小儿支原体感染，首先出现咽炎、鼻炎、气管炎、肺炎等。常有发烧、头痛、咳嗽、全身不适。体温常达39℃左右，发烧时间可长达1-2周。咳嗽初期为干咳，后转入顽固性剧烈咳嗽，无痰或少痰。婴幼儿表现为喘憋和呼吸困难。支原体感染除引起严重肺炎外，还可引起心肌炎、脑炎、肝炎、血小板减少、肾脏捐害等。
肺炎支原体感染的治疗，主要是大环内酯类药物红霉素或阿奇霉素。疗程短则1-2周，长则3-4周，甚至更长。因为肺炎支原体抗体检测受感染时间限制，对疑似近期感染者，在未取得检测结果前，经验性选择大环内酯类药物治疗，是十分必要的。经有效抗生素治疗可缩短病程，减轻症状，减少并发症的发生。如治疗不彻底，不能完全清除病原体则病情易复发，甚至可从患儿呼吸道分泌物中分离出肺炎支原体达数月之久，从而成为感染的传播者。
若不见效可要求医生更换药物，静脉注射病情稳定后医生会开相应口服用药(一般是阿奇霉素和营养类药物)，必须按照医嘱准时足量服用。该病治疗时间较长，家长必须耐心，长时间的治疗才能完全彻底治疗。另外，不能吃甜、过咸、油炸、油腻、酸、冷、硬的食物，可多吃一些流食、清淡(如稀饭、米粥、烧青菜)的食物，平时还要多喝水或果汁(果汁要加水)，还可以做点瘦肉粥、鱼肉粥之类的。
