一、慢性盆腔炎
其中輸卵管炎是引起女性不孕的主要原因，人工流產術可不同程度導致一側或雙側輸卵管阻塞，其原因可能有：宮腔操作可引起輸卵管炎，輸卵管充血、水腫、出血、壞死，輸卵管增粗或肉芽組織增生，使輸卵管碎片沿著輸卵管逆流等，也可以引起輸卵管炎及盆腔炎，並常遺留輸卵管周圍粘連及盆腔炎。
輸卵管阻塞發生與人工流產的次數有關，人工流產次數越多導致輸卵管阻塞的機會越大。
炎症不僅引起輸卵管堵塞且因瘢痕形成使輸卵管壁僵硬和輸卵管周圍粘連影響輸卵管蠕動，同時輸卵管內膜炎症破壞而影響纖毛運動，都能妨礙精子的通過而造成不孕。
二、宮頸粘連
宮腔粘連主要與人流術後產生的創傷、感染、N反射、子宮內膜再生障礙有關。人工流產後，宮頸內口是子宮最狹窄的部位，且粘膜較薄，術時易致深層受損，受損部位發生炎性滲出，修復時易粘連甚至瘢痕化。
子宮粘連發生率與人工流產次數呈正相關關係，慢性生殖系統炎症術前未經治療，術時消毒不嚴，術後過早性生活，引起感染促使子宮粘連形成。
三、子宮內膜異位症
有作者提出宮腔內容物逆流入腹腔是造成子宮內膜異位症的重要原因，且孕周越大，吸宮負壓越高逆流入腹腔越多。作者mase曾報道子宮內膜異位症患者的不孕發生率達30%~40%。
對於不孕的機理，國內外學者經多年研究提出種種學說，觀點如下：1、異位子宮內膜前列腺素分泌增多;2、內分泌失調致不排卵;3、黃素化卵泡不破裂綜合徵;4、高泌乳素血癥;5、自身內分泌問題。可見子宮內膜異位症合併不孕是各因素造成的，其相互之間的聯繫還有待深入研究。
四、對內分泌功能的影響
人工流產對卵巢功能具有一定程度的影響，卵巢的生理功能包括排卵和內分泌，卵巢功能失調可導致多種內分泌疾病，如月經紊亂、閉經、不孕症、卵巢早衰等，女性的生殖在很大程度上取決於下丘腦-垂體-卵巢軸系結構和功能的穩定。
妊娠後，與生理有關的各種激素都發生較大的變化，對下丘腦-垂體-卵巢軸產生較強的抑制。人工流產後，這種抑制還將維持一段時間，垂體對LRH 的反應敏感性需要一段時間才能恢復，按照國內外通行的方法：通過基礎體溫測定和B超監測，結合宮頸粘液觀察及排卵後孕酮的測定，判斷術後卵巢功能的恢復，有較高的準確性。
