輸血和移植配型
在臨床輸血中如果受血者血液含有針對供血者紅細胞抗原的抗體，常導致嚴重的溶血性輸血反應。輸入的血液如含有針對受血者紅細胞抗原的抗體則並無妨礙。這是因為輸入的抗體立即被受血者的血液稀釋，併為組織細胞所吸收的緣故。因此輸血配型的原則是輸入的紅細胞不能具有受血者所缺的抗原。
臨床器官移植中選擇供者和受者時，必須使紅細胞血型相配合,其原理與輸血配型完全相同。ABO血型必須配合,Rh血型和P血型對移植物存活的影響尚無定論。在受者使用免疫抑制劑的情況下，未見其他血型系統有影響。
新生兒溶血癥
這是胎兒與母親紅細胞血型不配合的結果。各種血型不配合都可引起新生兒溶血癥，其中以Rh血型不配合引起的溶血癥最為嚴重。在中國多見的是症狀較輕的ABO新生兒溶血癥。
親子鑑定
根據血型遺傳規律可排除親子關係。例如O型母親有一個A型的孩子，則B型和O型的男子不可能是這孩子的生物學父親，餘類推。
基因定位
某些血型基因座位在染色體上的位置已經確定，如Duffy、Rh、Scianna、Dombrock等座位在第一號染色體上，P座位在第6號染色體上，Colton和Kidd座位在第7號染色體上,ABO座位在第9號染色體上，Xg座位在X染色體上。 這些血型可以作為體細胞雜交基因定位研究中的重要的遺傳標誌。
疾病遺傳研究
利用 Xg血型可確定X染色體的來源。例如特納氏綜合徵女孩的性染色體是X0，假定該女孩是Xg(a+)，父親也是Xg(a+)，而母親是Xg(a-)，那麼她的X 染色體必定來自父親。又例如克氏綜合徵男孩的性染色體是XXY，假定該男孩是Xg(a+),母親是Xg(a-)，那麼他必定除了Y染色體外還有一條X染色體來自父親。血型也可以作為遺傳標誌被應用於產前診斷。 例如已知ABH的分泌基因 (Se)和杜氏肌營養不良症的致病基因是X染色體上兩個緊密連鎖的基因，由於重組率很低，所以只要在有該病患兒娩出史的孕婦的羊水中檢出ABH,就可判斷其胎兒可能是患兒。
群體遺傳學和人類學的研究
血型這一性狀不受環境的影響而改變，身體中即使個別體細胞的血型基因發生突變，也不致影響到個體血型的改變，也不會發生血型的選擇作用。因此血型在人群中的分佈差別、同一種血型在不同民族和不同人種中的差別以及同一民族或同一人種中各種血型的頻率都是群體遺傳學和人類學的重要研究內容。
