1.幼年孔雀魚公母的分辨
對於幼年孔雀魚，一般如果發育比較正常，一般來說，一個月左右的小魚就能分辨公母了。如果一個多月還難以分辨，則可能是食物或者水質不好導致小魚生長髮育太慢。同時，其也會受溫度、餌料、品系、個體差異等因素影響，快或者慢一禮拜左右都正常。此時的辨別公母，未必能依靠“臀鰭尖還是圓”等成年孔雀的辨性方法來進行。但在臀鰭發生明顯變化前，也是可以分辨公母的：
1)一般來說公魚先發色。
2)看肚子後部：小母魚可見肚子裡面的顏色(大母魚“胎斑”的雛形)，小公魚則是白肚皮包著，基本看不到裡面顏色。
2.成魚孔雀魚公母的分辨
孔雀成魚好分辨。
1)母魚顏色也不如公魚鮮豔。公魚身上的鰭很大，體色很漂亮，有很多花紋。而母魚不是，母魚的鰭短小，體色單一，無絢麗的花紋，但是鰭上有花紋的母魚品質較好。
2)公魚尾巴比較大，母魚尾巴較小。成體雄魚體長3釐米左右，身體短，尾部長佔體長的2/3左右，甚至可以更大;成體雌魚體長可達5~6 釐米，身體長，尾鰭短，尾部長佔體長的1/2以上，一般尾巴上都是黑色的。
3)公魚臀鰭是長棒，母魚臀鰭是扇形的。公魚的腹鰭細長，鰭尖有個小鉤，母魚的腹鰭寬大且短。雄魚的特點就是腹部較小，瘦長，最關鍵的就是他的臀鰭演變出交接器，用於繁殖時候輸送精子用。所以雄魚的臀鰭前方的幾根鰭條比較粗大。而雌魚的臀鰭則是均勻的。
4)胎斑只有母魚才有，公魚沒有胎斑。公魚全身都是漂亮的花紋，因此看不見腹腔內的內臟，而母魚身體偏透明，其肛門處若出現黑斑則表明它已有身孕(也有品種是紅色的胎斑)胎斑越大則越接近生產。
如果是1~3個月沒髮色的孔雀，只能看臀鰭，臀鰭尖的是公魚，臀鰭圓的是母魚。
