鹼性磷酸酶屬於同源二聚體蛋白，分子量為56KDa。每個單體由449個氨基酸組成，完整的AKP分子呈現典型的α/β的拓撲結構，同時每個單體均具有一個活性中心，活性中心區域由Asp101-Ser102-Ala103三連體、Arg166、水分子、三個金屬離子及其配體氨基酸組成。AKP被phoA 基因編碼，與很多分泌蛋白一樣，在細胞質內合成氨基末端帶有信號肽的單體前體，信號肽引導前體跨內膜運輸後被切除，同源二聚體形成。
鹼性磷酸酶是一種能夠將對應底物去磷酸化的酶，即通過水解磷酸單酯將底物分子上的磷酸基團除去，並生成磷酸根離子和自由的羥基，這類底物包括核酸、蛋白、生物鹼等。而該脫去磷酸基團的過程被稱為去磷酸化或脫磷酸化。鹼性磷酸酶是磷酸酶的一種，磷酸酶的作用與激酶的作用正相反，激酶是磷酸化酶，可以利用能量分子，如ATP，將磷酸基團加到對應底物分子上。鹼性磷酸酶在鹼性環境有最大活力，對來源於細菌中的ALP來說，其最適pH是8.0，而對來源於牛的ALP則是8.5。
鹼性磷酸酶是廣泛分佈於人體肝臟、骨骼、腸、腎和胎盤等組織經肝臟向膽外排出的一種酶。這種酶能催化核酸分子脫掉5’磷酸基團，從而使DNA或RNA片段的5’-P末端轉換成5’-OH末端。但它不是單一的酶，而是一組同功酶。目前已發現有 AKP1 、 AKP2 、 AKP3 、 AKP4 、 AKP5 與 AKP6 六種同功酶。其中第 1 、 2 、 6 種均來自肝臟，第 3 種來自骨細胞，第 4 種產生於胎盤及癌細胞，而第 5 種則來自小腸絨毛上皮與成纖維細胞。
鹼性磷酸酶主要用於阻塞性黃疸、原發性肝癌、繼發性肝癌、膽汁淤積性肝炎等的檢查。患這些疾病時，肝細胞過度製造ALP，經淋巴道和肝竇進入血液，同時由於肝內膽道膽汁排洩障礙，反流入血而引起血清鹼性磷酸酶明顯升高。但由於骨組織中此酶亦很活躍。因此，孕婦、骨折癒合期、骨軟化症。佝僂病、骨細胞癌、骨質疏鬆、肝膿腫、肝結核、肝硬變、白血病、甲狀腺機能亢進時，血清鹼性磷酸酶亦可升高，應加以鑑別。
