野生靈芝:菌蓋木栓質,形態各異、長在一起的雄雌兩株形態相似,香味濃。人工栽培的靈芝每朵形態都一樣。靈芝未成熟時菌蓋邊沿有一圈嫩黃白色生長圈、成熟後消失並噴出孢子粉。野生赤芝並不是都有菌柄,有柄或近無柄或無柄;紫芝有柄極少數無柄或近無柄。
靈芝菌柄紅褐色至黑色,都有漆樣光澤,堅硬。靈芝生長中的光線過低就只長菌柄、不開片,如鹿角芝、靈芝草類。野生赤芝的菌蓋少數有天然漆樣光澤,經洗淨烘烤乾後,菌蓋會溢出漆樣光澤的靈芝油,有環狀稜紋和輻射狀皺紋。
野生靈芝大小和形態變化較大。菌背面,有無數細小管孔,管口呈白色或淡褐色,靈芝生長初期菌背面一眼看去就一片白色,每毫米內有4~5個管孔,管口圓形,內壁為子實層。靈芝種子(孢子),卵圓形,壁兩層,針尖大小,褐色,集多粉末狀。