結核桿菌為專性需氧菌,對某些理化因子的抵抗力較強,結核桿菌無內毒素,也不產生外毒素和侵襲性酶類,其致病作用主要靠菌體成份,特別是胞壁中所含的大量脂質,脂質含量與結核桿菌的毒力呈平行關係,含量愈高毒力愈強,結核桿菌的致病作用可能是細菌在組織細胞內頑強增殖引起炎症反應,以及誘導機體產生遲髮型變態反應性損傷有關,結核桿菌可通過呼吸道,消化道和破損的皮膚粘膜進入機體,侵犯多種組織器官,引起相應器官,引起相應器官的結核病。
咽結核多為肺結核病人痰中結核桿菌接觸損傷的咽部粘膜而發病,或由喉結核向上蔓延而來,也可發生於結核桿菌的血行播散。