誘發錯頜畸形的原因很多，主要包括遺傳因素和環境因素。環境因素又包括先天因素和後天因素。
一、先天因素：是指胎兒在母親子宮內生長髮育過程中受到的各種影響，可能是母親或胎兒的營養代謝失調，母親患風疹或感染病毒，母親懷孕期間受到外傷或分娩時造成的產傷。 二、後天因素：是指出生後在生長髮育過程中受到的影響。
1、疾病：某些急性傳染病，某些慢性消耗性疾病可能影響到牙齒和頜骨的發育。內分泌功能紊亂或營養不良尤其是維生素缺乏可能會影響到牙齒和頜骨的發育。
2、呼吸和吞嚥功能異常：呼吸和吞嚥功能異常可能會影響牙齒和頜骨的發育。
3、不良習慣：比如咬手指，咬上唇或咬下唇習慣，伸舌或吐舌習慣。
4、乳牙期或替牙期出現的問題：包括乳牙過早喪失，乳牙遲遲不掉，恆牙過早喪失，恆牙萌出順序紊亂等等都會造成牙齒不齊。
三、影響美觀，帶來疾病：影響面容美觀。牙齒不齊容易導致刷牙刷不乾淨，所以容易長齲齒和牙石，影響牙齒和牙周健康。同時因為上下咬合關係不好，會影響吃飯，咀嚼功能下降，加重胃腸負擔，從而影響身體健康。有時候還會影響發音。
四、精神因素：錯牙合畸形對兒童及成人均能造成心理和精神影響。嚴重者有自卑感，與人交往困難，甚至抑鬱。筆者曾在臨床發現一例患者，由於錯牙合畸形引起抑鬱症，給家人和自己帶來了不可磨滅的傷痛。
