牙菌斑為牙周炎的主要致病菌，因此對於牙菌斑的清除非常重要，現對清除牙菌斑的主要方法描述如下。
1.刷牙：刷牙是清除牙菌斑的基本措施，也是最重要的一種方法。如果刷牙得當就可以使牙齒表面的牙菌斑量大為減少。因此我們必須養成每天早晚刷牙的好習慣,並掌握正確的刷牙方法。
2.牙線: 單純採用刷牙的方法不能有效的清除牙齒鄰面的牙菌斑，因此需要使用其他一些輔助用品.牙線是其中之一, 牙線能有效的清除牙齒鄰面的牙菌斑,預防牙周疾病和鄰面齲。
3.牙籤: 在牙齦萎縮，牙與牙之間出現間隙(牙縫)的情況下，就要藉助牙籤來清除牙齒鄰接面的食物、軟垢和部分牙菌斑。目前我國市場上出售的牙籤的橫斷面是圓形的,國外也有橫斷面為三角形的牙籤。
4.牙間刷: 牙間刷由刷毛和持柄兩部分構成，在設計和規格方面有多種多樣，可根據牙間隙的大小進行選用，能有效清除牙齒鄰接面的牙菌斑。
5.牙膏: 刷牙時要使用牙膏用以摩擦牙面，加強刷牙時清除牙菌斑的作用，使牙齒清潔美觀。牙膏中的芳香劑還有爽口、減輕口臭的作用。若在牙膏中加入一些藥物稱為藥物牙膏。通過用藥物牙膏刷牙可起到一些相應的作用，但若有牙病還是要先去看牙醫,聽聽醫生的建議，而不能單純依靠某種牙膏來自行治療您的牙病，
以免耽誤您的病情。
6.漱口和漱口液: 漱口是清潔口腔的一種方法，主要原理是利用液體在口內流動的衝擊力來清除滯留的食物殘渣，但漱口不能清除牙菌斑。在漱口水中加入一些藥物成分，稱為漱口液。漱口液可減少牙菌斑的形成，對減少齲病和牙周疾病的發生起一定作用，但也不能濫用。
總之，牙菌斑在牙面是不斷形成的，清潔牙面後新的牙菌斑又會出現，因此每個人要從小養成早晚刷牙，飯後漱口的好習慣，並持之以恆、貫穿終生，在一生中要不斷的、徹底的清除牙菌斑，以保持牙齒健康。
