1.牛蒡含有大量的鐵質，只要曝露在空氣中就會氧化成黑褐色，為了避免變色，切好的牛蒡要立刻放入清水中浸泡才不會氧化(將牛蒡絲刨在水裡當水變成鐵鏽色時，必須再換清水，否則不能保持牛蒡的原色)，也可將處理好的牛蒡泡入濃度3%的醋水中15分鐘，一來可使牛蒡的色澤更加潔白，二來也可保有牛蒡本身的特殊香氣。
2.牛蒡若一時吃不完，可以先將要食用的份量切下清洗，原則上較細的一端先食用，剩餘的部份不要碰到水，用報紙或保鮮膜包住，放在陽光曬不到的陰涼場所，另外也可用沾溼的報紙包裹牛蒡，放在冰箱冷藏室的最下層即可。
3.如果買回來的牛蒡還帶有葉子，必須先將葉子切除再保存，否則葉子會繼續吸收水份，讓牛蒡可食用的部份變得乾枯;如果真的保存過久，牛蒡已經風乾枯萎了，不妨先放在水中一段時間後再行烹調。
4.可以將牛蒡煮熟後分裝在塑膠袋中，再放入冷凍庫中保存，如此不但能延長保存期限，烹調時也只需解凍即可使用，十分快速方便。
