慢性角膜炎的併發症包括以下幾點：
1、前房積膿嚴重病例多合併有虹膜睫狀體炎。由於虹膜睫狀體滲出的白細胞使前房房水混濁，沉著於前房角下部，名叫前房積膿。因其為液體故呈水平面。當頭部傾斜時，液體漸向低處改變方向。前房積膿的多少極不一致，輕者僅見一黃色新月形線條在前房下角，重者則充滿前房。前房積膿可能完全被吸收(愈稀薄愈容易被吸收)。纖維滲出物可形成結締組織，產生虹膜周邊前或後粘連，甚至使瞳孔閉鎖。睫狀體受累者角膜後壁有沉著物。
2、後彈力膜膨出因為角膜潰瘍可向深層進展，當角膜幾將穿孔時，在潰瘍基底可出現一薄層透明組織，形如“黑色”小泡向前突出，其周邊為灰色潰瘍所圍繞。這一凸起乃後彈力膜所形成，故名後彈力膜膨出。這是因為後彈力膜質地堅韌，富有彈力，它不但能抵抗炎症的破壞，又可抵抗眼壓。因為老年人的後彈力膜較年輕者為厚，所以在某些老年患者後彈力膜膨出可以持續數週。這在青年和幼兒患者則很少見到，因其常被瞬息間的眼壓增高如咳嗽、打噴嚏、眼瞼痙攣等所穿破。檢查時不小心，強力分開眼瞼，也常會使之穿破。
3、角膜穿孔當角膜穿孔時，患者即感覺到猛烈的疼痛和熱淚(房水)流出，但原有的疼痛症狀則消失;穿孔後房水溢出，首先前房變淺甚至消失，繼則虹膜和晶狀體向前移位而與角膜後壁接觸，眼球變軟。瞳孔以往雖曾使用阿托品散大，但這時也會縮小。角膜穿孔後，按穿孔的大小和部位，結局各有不同。
4、前極白內障如果穿孔小，位於角膜中央部，虹膜可不脫出即開始癒合。當房水流出後，穿孔處尚未被足夠濃厚的纖維滲出物堵塞時，則晶狀體與角膜後壁持續接觸，待前房形成，晶狀體前囊與角膜後壁脫離接觸時，則晶狀體中央部的前囊表面及囊下組織已發生永久性的混濁，形成後天性前極白內障。
