慢性腸炎泛指腸道的慢性炎症性疾病，其病因可為細菌、黴菌、病毒、原蟲等微生物感染，亦可為過敏、變態反應等原因所致。臨床表現為長期慢性、或反覆發作的腹痛、腹瀉及消化不良等症，重者可有粘液便或水樣便。
(1)原發性小腸吸收不良綜合徵：本病典型症狀為脂肪瀉。大便色淡，量多，呈油脂狀或泡沫狀，常浮於水面多有惡臭味。多伴腹脹、腹痛，有乏力、體重下降、出血等營養不良表現，病程長，病情時輕時重，做X線鋇餐檢查有利診斷。
(2)腸結核：起病緩慢，多位於右下腹部，可有陣發性絞痛，腸鳴音增強，常有大便習慣改變，幹、稀交替。輕者僅有稀便，重者為粘液膿血便。可有噁心、嘔吐、腹脹，食慾減退。體檢僅有右下腹壓痛。輔助檢查：血沉增快，結腸菌試驗陽性，大便培養可找到抗酸桿菌。給予纖維腸鏡檢查以確認本病。
(3)克隆病：是一種原因不明的慢性腸道炎症性疾病，起病緩慢，有消瘦、納呆、乏力等表現。腹痛位於臍周或右下腹。腹瀉初為間歇性，以後漸為持續性。日行3～6次，軟便或半液狀。右下腹壓痛，可觸及包塊。晚期呈現消瘦、貧血、腸吸收不良及電解質紊亂等表現。腸繫膜動脈造影或內窺鏡及活組織檢查，可明確診斷。
(4)特發性潰瘍性結腸炎：本病原因不明，是與免疫有關的慢性病，多以潰瘍為主，累及結膜粘膜，以青壯年多見。腹痛常在左下腹或全腹壓痛明顯，伴腸鳴音亢進。有食慾減退，體重下降及營養不良等症狀。可行乙狀結腸鏡和活組織檢查以利診斷。
(5)胃腸神經官能症：此病是高級神經功能紊亂引起的胃腸功能障礙。起病較慢，臨床表現以胃腸道症狀為主，表現神經性噯氣、厭食、嘔吐、精神性腹瀉、結腸激惹症，脾曲綜合徵等。
(6)強制性脊柱炎。像是慢性腸炎、反覆尿路感染、銀屑病等，在一些病人的眼裡都是輕易不傷及人性命的疾病，但就是這些疾病卻會引起人體骶髂關節發生炎性改變，導致強直性脊柱炎的發生。當身體關節有疼痛時，不要急於用藥，消炎藥或是鎮痛藥等雖然能暫時緩解痛感，但對某些疾病的治療起不到根本性的作用，有時還會因為掩蓋了病情的本質而給後續治療帶來困難。
