鮮黃花菜裡含有一種叫秋水仙鹼的物質。它自身雖然無毒，但進入人體被氧化成氧化二秋水仙鹼後就具有毒性了。氧化二秋水仙鹼對胃腸黏膜和呼吸器官黏膜有強烈的刺激作用，鮮黃花菜中毒的潛伏期短者10分鐘～30分鐘，潛伏期長者4小時～8小時。一旦中毒，便會出現咽乾、燒心、口渴、噁心、嘔吐、腹痛、腹瀉等症狀。個別重者會有發冷、發熱、口渴、四肢麻木等症狀。
由於鮮黃花菜的有毒成份秋水仙鹼易溶於水，在高溫60度時可減弱或消失，因此食用時，應先將鮮黃花菜用開水焯過，再用清水浸泡2個小時以上，撈出用水洗淨後再進行炒食，這樣秋水仙鹼就能破壞掉，食用鮮黃花菜就安全了，並且每次食用不超過50克為好。每50克鮮黃花菜約含0.1毫克的秋水仙鹼，成人如果一次食入鮮黃花菜超過50克即可引起中毒。食用幹品時，消費者最好在食用前用清水或溫水進行多次浸泡後再食用，這樣可以去掉殘留的有害物，如二氧化硫等醫`學教育網整理。
