1、治療肛管炎可口服抗生素，治療引起該病的腹瀉等腸道感染;或使用緩瀉劑，使糞便排洩正常，如麻仁潤腸丸等。
2、治療肛管炎可以使用各種痔瘡栓和痔瘡膏。
3、治療肛管炎可以溫鹽水坐浴局部，使局部保持清潔，並可在肛竇底部塗5%~10%硝酸銀溶液，每日1次。也可用橄欖油30~60mL灌腸。
4、治療肛管炎可以選用水楊酸偶氮磺胺吡啶,發作期成人開始每日2-3克,分3-4次服,如無不良反立,則逐日增至每日4~6克,分3~4次服,症狀好轉後漸減至每日1~2克,分3次服,至少維持1年,89%的人可保持無症狀.增大用量雖可提高療效,但副作用也增加。
5、肛管炎的手術治療切口應距離肛緣3-5cm，以免損傷括約肌。應置管或放置油紗布條引流。骨盆直腸間隙膿腫要在腰麻或全麻下進行，切開部位因膿腫來源不同而不同:
發生肛管炎，要及時到正規的醫院進行治療，不可疏忽大意，患者要注意飲食清淡，要養成按時排便的好習慣，要注意休息，避免過度疲勞，要配合醫生的治療。
