目前對付蠅蛆病尚無特效治療方法。一般多待幼蟲自行排出，或擠壓腫塊促使幼蟲排出，排出後酌用氯仿沖洗腫塊內臟，或用2%普魯卡因局麻後，切開取出幼蟲。
可試用氯喹0.25g，每天2次，共服2～3周，或乙胺嗪(海群生)0.2g，每天3次，共14天為一療程，有繼發感染者酌用抗生素。內服抗組胺劑或潑尼松，止癢，止痛，減輕全身反應，降低血液嗜酸性粒細胞作用，局部用消炎止癢洗劑。中醫局部治療，可用竹刀刻破，以絲瓜葉擠汁搽之，蛆出盡愈，亦可局部點塗白降丹後用黑布代毒膏貼敷，待破潰後再用白降丹藥捻入隧，使蠅蛆死亡，壓迫排除即可。
臨床試驗中，用手擠壓腫塊以捏死幼蟲，若腫塊淺表亦可用液氮冷凍殺死蠅蛆效果是不錯的。在幼蟲快要鑽出皮膚時用鑷子取出幼蟲或用刮匙刮除。紅腫明顯的腫塊和結節可手術切開取出幼蟲，腫塊的內腔或潰傷面用15%氯仿植物油灌洗，每日1次至傷面痊癒。另外可試用氯喹0.25 g，每日2～3次，或用乙胺嗪0.2 g，每日3次，連服2周。
