1.全身症狀
全身症狀常突出，一般在感染後數週出現發熱、體重下降、倦怠無力和大汗。熱型為中至高熱。每日1～2個高峰，多不受退熱藥影響。通常持續10～40天，可自行緩解。
2.關節炎
首發症狀以急性關節炎多見，典型的關節炎出現在尿道或腸道感染後1～6周。呈急性發病。多為單一或少關節炎，非對稱性分佈，呈現伴關節周圍炎的臘腸樣指(趾)。關節炎一般持續1～3個月，個別病例可長達半年以上。主要累及膝及踝等下肢大關節。肩、腕、肘、髖關節及手和足的小關節也可累及。受累關節呈熱、腫脹、劇痛和觸痛。膝關節常有明顯腫脹及大量積液。背部不適常放射到臀部和大腿。在臥床休息和不活動時加重。肌腱端病的典型表現是跟腱附著點炎。初次發病症狀通常在3～4個月內消退，並可恢復正常。但有復發傾向，某些患耆可在反覆發作過程中發生關節畸型、強直、骶髂關節炎和(或)脊柱炎。
3.泌尿生殖道炎症
典型患者是在性接觸或痢疾後7～14天發生無菌性尿道炎。男性患者有尿頻和尿道燒灼感。尿道口紅腫，可見清亮的黏液樣分泌物。也可出現自發緩解的出血性膀胱炎或前列腺炎。旋渦狀龜頭炎為陰莖龜頭和尿道口無痛的淺表性紅斑潰瘍，見於20%～40%的男性患者。龜頭炎的發生與尿道炎的有無或輕重無關。龜頭炎一般在幾天或幾周痊癒，極少數可持續幾個月。女性患者可表現為無症狀或症狀輕微的膀胱炎和官頸炎，有少量陰道分泌物或排尿困難。
4.皮膚黏膜表現
超過50%的患者可出現皮膚黏膜症狀。溢膿性皮膚角化症為病變皮膚的過度角化，見於10%～30%的患者。通常出現於足底和手掌，也可累及指甲周圍、陰囊、陰莖、軀幹和頭皮。開始為紅斑基底上清亮的小水皰，然後發展成斑疹、丘疹並形成角化小結節。這種皮損無論從臨床表現還是從組織病理上都很難與膿皰性銀屑病相鑑別。類似於銀屑病的指甲角化也可見於6%～12%的患者。5%～15%的患者可出現一過性淺表性腔潰瘍，潰瘍多位於硬顎和軟顎、牙齦、舌和頰黏膜，開始表現為水皰，逐漸發展成淺小、有時融合的潰瘍，多為無痛性。結節紅斑是耶爾森菌感染的臨床表現，常見於女性、 HLA-B27陰性及缺乏胃腸道症狀的患者。
5.眼部症狀
1/3的反應性關節炎患者可出現結膜炎，通常症狀較輕，常在關節炎發作時出現，可以是單側或雙側受累，伴有無菌性分泌物。1～4周多可自發緩解，但很易復發。5%的患者出現急性前色素膜炎，表現為眼睛疼痛、發紅和畏光，預後一般較好，但是如不治療，有11%的患者可出現失明。角膜炎、角膜潰瘍、表面鞏膜炎、視神經和球后神經炎、前房出血也可見於持續性或慢性患者。
6.心臟表現
心臟表現可包括主動脈病變和傳導異常。主動脈環和升主動脈是通常受累的部位，少數患者由於主動脈中層病變和主動脈根部擴張，最終發生主動脈瓣關閉不全。5%～14%的患者可出現心電圖異常。慢性病患者(病程超過10年)最常報道的為I度房室傳導阻滯，可能進展為Ⅱ度或完全性房室傳導阻滯。有研究提示，約6%的鏈球菌感染後反應性關節炎患者可在病程中出現心臟炎，因此提出對鏈球菌感染後的患者仍應給予預防性抗生素治療，以避免鏈球菌感染的進一步關節損害或者心臟炎的出現。
7.其他
蛋白尿、鏡下血尿或無菌性膿尿可見於約50%的性傳播型反應性關節炎，且常常是無症狀的：腎小球腎炎和IgA腎病可見於少數患者，嚴重的系統性壞死性血管炎、血栓性淺表性靜脈炎、紫癜、澱粉樣變性、顱神經和周圍神經病也是慢性病患者少見的併發症。
