豆製品雖然營養豐富，色香味俱佳，但也並非人人皆宜，患有以下疾病者都應當
豆製品忌食或者少吃：
(1)消化性潰瘍：嚴重消化性潰瘍病人不要食用黃豆、蠶豆、豆腐絲、豆腐乾等豆製品，因為其中嘌呤含量高，有促進胃液分泌的作用;整粒豆中的膳食纖維還會對胃粘膜造成機械性損傷。豆類所含的低聚糖如水蘇糖和棉子糖，雖然不能被消化酶分解而消化吸收，但可被腸道細菌發酵，能分解產生一些小分子的氣體，進而引起嗝氣、腸鳴、腹脹、腹痛等症狀。
(2)胃炎：急性胃炎和慢性淺表性胃炎病人也不要食用豆製品，以免刺激胃酸分泌和引起胃腸脹氣。
(3)腎臟疾病：腎炎、腎功能衰竭和腎臟透析病人應採用低蛋白飲食，為了保證身體的基本需要，應在限量範圍內選用適量含必需氨基酸豐富而含非必需氨基酸又低的食品，與動物性蛋白質相比，豆類含非必需氨基酸較高，故應禁食。
(4)糖尿病腎病：引起糖尿病患者死亡的主要併發症是糖尿病腎病，當病人有尿素氮瀦留時，也不宜食用豆製品。
(5)傷寒病：儘管長期高熱的傷寒病人應攝取高熱量高蛋白飲食，但在急性期和恢復期，為預防出現腹脹，不宜飲用豆漿，以免產氣。
(6)急性胰腺炎：急性胰腺炎發作時，可飲用高碳水化合物的清流質，但忌用能刺激胃液和胰液分泌的豆漿等。
(7)痛風：痛風的發病機理是嘌呤代謝紊亂，以高尿酸血癥為重要特徵。該病多見於富裕家庭中，高蛋白高脂肪膳食容易引起痛風。食物蛋白質多與核酸結合成核蛋白，其中核酸分解為嘌呤，繼而分解為尿酸。因此在急性期要禁用含嘌呤多的食物，其中包括幹豆類及豆製品，即使在緩解期也要有限制地食用。
(8)半乳糖及乳糖不耐受症：由於這些病人體內缺乏與半乳糖和乳糖分解、代謝有關的酶，在飲食上應忌食含乳糖的食物。豆類食品中的水蘇糖和棉子糖在腸道分解後可產生一部分半乳糖，所以，嚴重患者應禁用豆製品，以免加重病情。
(9)苯丙酮酸尿症：這是兒童常見的一種先天性代謝缺陷病。對這種病的治療方法主要是依靠食用特製的低苯丙氨酸食品來控制血液中苯丙氨酸的濃度，同時注意禁食或少用富含蛋白質的豆製品和動物性食品等。
