番紅花是多年生草本植物。球莖扁圓球形，直徑約3釐米，外有黃褐色的膜質包被。葉基生，9-15枚，條形，灰綠色，長15-20釐米，寬2-3毫米，邊緣反捲;葉叢基部包有4-5片膜質的鞘狀葉。花莖甚短，不伸出地面;花1-2朵，淡藍色、紅紫色或白色，有香味，直徑2.5-3釐米;花被裂片6，2輪排列，內、外輪花被裂片皆為倒卵形，頂端鈍，長4-5釐米;雄蕊直立，長2.5釐米，花葯黃色，頂端尖，略彎曲;花柱橙紅色，長約4釐米，上部3分枝，分枝彎曲而下垂，柱頭略扁，頂端楔形，有淺齒，較雄蕊長，子房狹紡錘形。蒴果橢圓形，長約3釐米。
完整的柱頭呈線形，先端較寬大，向下漸細呈尾狀，先端邊緣具不整齊的齒狀，下端為殘留的黃色花枝。長約2.5釐米，直徑約1.5毫米。紫紅色或暗紅棕色，微有光澤。體輕，質鬆軟，乾燥後質脆易斷。將柱頭投入水中則膨脹，可見橙黃色成直線下降，並逐漸擴散，水被染成黃色.無沉澱柱頭呈喇叭狀，有短縫。在短時間內用針撥之不破碎。氣特異，微有刺激性，味微苦。以身長，色紫紅，滋潤而有光澤，黃色花柱少，味辛涼者為佳。
