胸骨後燒灼感或疼痛：為本病的主要症狀。症狀多在食後1小時左右發生，半臥位、軀體前屈或劇烈運動可誘發，在服制酸劑後多可消失，而過熱、過酸食物則可使之加重。胃酸缺乏者，燒灼感主要由膽汁反流所致，則服制酸劑的效果不著。燒灼感的嚴重程度不一定與病變的輕重一致。嚴重食管炎尤其在瘢痕形成者，可無或僅有輕微燒灼感。
胃、食管反流：每於餐後、躺體前屈或夜間臥床睡覺時，有酸性液體或食物從胃、食管反流至咽部或口腔。此症狀多在胸骨後燒灼感或燒灼痛發生前出現。
嚥下困難：初期常可因食管炎引起繼發性食管痙攣而出現間歇性嚥下困難。後期則可由於食管瘢痕形成狹窄，燒灼感和燒灼痛逐漸減輕而為永久性嚥下困難所替代，進食固體食物時可在劍突處引起堵塞感或疼痛。
出血及貧血：嚴重食管炎者可出現食管粘膜糜爛而致出血，多為慢性少量出血。長期或大量出血均可導致缺鐵性貧血。
