脫水和電解質紊亂腹瀉時機體不僅不能有效地從食物中吸收水份和電解質，而且還會以腸液的形式將它們進一步丟失。所以腹瀉時，如果不能及時有效地補充水份和電解質的話，就會出現不同程度的脫水和電解質紊亂。其中，電解質紊亂包括低鈉、低鉀、低鈣和低鎂，它們不僅不利於疾病的恢復，而且還會給孩子帶來不必要的痛苦，例如低鉀可引起頑固性的腹脹，低鈣可引起手足抽搦或驚厥。
病毒性心肌炎它發生在腸道病毒感染所致的腹瀉之後，腹瀉使患兒的抵抗力進一步下降，病毒就可侵犯心臟而引起病毒性心肌炎。併發此病的患兒會有胸悶、胸痛、心悸、頭暈、乏力等症狀。重症患兒會因為嚴重的心律失常導致心力衰竭、心源性休克，甚至危及生命。
腸套疊嬰兒常見的急腹症之一，多見於4～10個月的嬰兒。隨著年齡的增長，發病率逐漸降低。絕大多數嬰兒腸套疊是原發性的，只有2%～8%的病例為繼發性。由於腸蠕動失去正常節律性，腸環肌發生持續性局部痙攣，腸近端劇烈蠕動，遂將痙攣的腸段推入遠端腸腔內。腹瀉和伴隨它的病毒感染是引起腸套疊的主要原因，應當引起警惕。
營養不良多發生在遷延性腹瀉或慢性腹瀉之後。營養不良會使患兒的抵抗力進一步下降，易繼發各種感染，如鵝口瘡、支氣管肺炎、結核病、中耳炎、尿路感染等，而且腹瀉遷延不愈還會加重營養不良，造成惡性循環。
