由於芍藥花型富有變化，從而使分類方法也有多種，目前多采用北京林業大學園林系的花型分類法。
芍藥根據顏色可分為白、黃、綠、粉、粉藍、紅、紫紅、紫、黑、復等多個品種。根據花型可分為薔薇型、皇冠型、千層臺閣型、託桂型、金環型、菊花型、繡球型、樓子臺閣型、單瓣型等。
中國產的芍藥組植物有八種和六個變種，其中通常直稱為芍藥的，是近代芍藥品種群的主要原種。八種芍藥分別是：草芍藥、美麗芍藥、芍藥、多花芍藥、白花芍藥、川赤芍、新疆芍藥和窄葉芍藥。
草芍藥別名山芍藥、野芍藥，花白色、紅色、紫紅色。其變種有毛葉草芍藥。
美麗芍藥花紅色。
芍藥花白色，有時基部具深紫色斑塊。其變種有毛果芍藥。
多花芍藥花白色。
川赤芍的花多為紫紅色或粉紅色。其變種有毛赤芍、光果赤芍、單花赤芍。
新疆芍藥的花紅色。
窄葉芍藥花紫紅。有變種塊根芍藥。
