1.肺結核
多有全身中毒症狀，午後低熱、盜汗、疲乏、無力、體重減輕、失眠、心悸等症狀。X線胸片可見病變多在肺尖或鎖骨上下，密度不勻，消散緩慢，且可形成空洞或肺內播散。痰中可找到結核桿菌。常規抗菌藥物治療無效。
2.肺癌
常有吸菸史。有咳嗽、咳痰、痰中帶血癥狀。血白細胞計數不高，痰中若發現癌細胞可以確診。可伴發阻塞性肺炎，經抗生素治療後炎症不易消散，或可見肺門淋巴結腫大，有時出現肺不張。必要時做CT、MRI、纖維支氣管鏡和痰脫落細胞等檢查。
3.急性肺膿腫
早期臨床表現相似。隨著病程進展，咳出大量膿臭痰為肺膿腫的特佂。X線片顯示膿腔及液平面。
4.肺血栓栓塞
肺血栓栓塞症多有靜脈血栓的危險因素，可發生咯血、暈厥，呼吸困難較明顯，頸靜脈充盈。X線胸片示局部肺紋理減少，可見尖端指向肺門的楔形陰影，常見低氧血癥及低碳酸血癥。D-二聚體、CT肺動脈造影、放射性核素肺通氣/灌注掃描和MRI等檢查可幫助進行鑑別。
5.非感染性肺部浸潤
需排除非感染性肺部疾病，如肺間質纖維化、肺水腫、肺不張、肺嗜酸性粒細胞浸潤症和肺血管炎等。
