痤瘡主要與皮脂分泌過多、毛囊皮脂腺導管的堵塞、細菌感染和炎症反應等因素密切相關。痤瘡發生的基本病理生理基礎是皮脂腺的快速發育和皮脂的過量分泌，青春期雄性激素水平快速上升促進了皮脂腺的發育併產生大量皮脂。
毛囊皮脂腺導管的異常角化是另一個重要因素：由於角質細胞的異化，導致角質層增厚和角質物堆積，使毛囊皮脂腺導管堵塞、皮脂排出障礙，最終形成角質栓也就是粉刺。
大量皮脂的分泌和排出障礙容易繼發細菌感染。毛囊中存在多種微生物，如痤瘡丙酸桿菌、白色葡萄球菌和糠秕馬拉色菌，其中以痤瘡丙酸桿菌最為重要，該菌為厭氧菌，皮脂的排出受阻，正好為其創造了良好的局部厭氧環境，使痤瘡丙酸桿菌大量繁殖，導致和加重炎症性損害。
除上述因素外，部分患者痤瘡的發生還和肌體的免疫狀況以及遺傳有關，特別是在一些特殊類型的痤瘡如聚合性痤瘡和暴發性痤瘡中，免疫反應發揮重要作用。
