1.生長髮育遲緩
除軀體生長髮育遲緩外,主要表現在智力發育遲緩,表現在智商低於同齡正常嬰兒,生後4~9個月即可出現,重型者智商低於50,約14%以上兒童達白痴水平,語言發育障礙尤為明顯,這些表現提示大腦發育障礙,限制新生兒攝入苯丙氨酸可防止智力發育障礙,重型PKU患兒智力發育障礙比輕型者血中苯丙氨酸濃度高,據此可以認為智力發育障礙與苯丙氨酸毒性有關,但更為詳細的病理生理機制仍不清楚。
2.神經精神表現
由於有腦萎縮而有小腦畸形,反覆發作的抽搐,但隨年齡增大而減輕,肌張力增高,反射亢進,常有興奮不安,多動和異常行為。
3.皮膚毛髮表現
皮膚常乾燥,易有溼疹和皮膚劃痕症,由於酪氨酸酶受抑,使黑色素合成減少,故患兒毛髮色淡而呈棕色。
4.其他
由於苯丙氨酸羥化酶缺乏,苯丙氨酸從另一通路產生苯乳酸和苯乙酸增多,從汗液和尿中排出而有黴臭味(或鼠氣味)。