由於磁化水在一些物理特性方面的變化，引起相應的生物學效應，因而對人體有著不同的作用。經過大量的試驗研究及臨床觀察發現磁化水有多種治療作用。雖然磁場強度不同，磁化水的生物效應不同，但在中等強度的磁場中，它的生物學作用和治療作用有以下幾個方面：
(1)防止動脈內皮細胞的損傷，抑制血清膽固醇的升高，能防止腦和心臟動脈硬化。許多試驗證明飲用磁處理水能引起血液方面的變化。有作者觀察到磁處理水使喂飼高膽固醇食物的大鼠血清中膽固醇含量仍是正常。也有人觀察到，飲磁處理水可使血清中高密度脂蛋白含量升高，低密度脂蛋白和甘油三脂含量降低，這些結果都說明磁處理水可以預防動脈粥樣硬化的發生。
(2)降低水、白酒等液體的黏度，有利於血液流動，防止腦和心臟血栓的產生。
(3)可使溶液的溶鈣能力明顯提高，有抑制結晶的能力，並能使已形成的結石發生疏鬆、碎裂、體積變小等改變，因而能治療泌尿系統結石、膽結石。對結石有一定的預防作用。
(4)使脾臟、胸腺重量增加，有提高抗病及抗衰老的能力。
(5)可使機體的IgG、IgM等免疫球蛋白的含量顯著升高，還可以提高肝、脾及血管內皮細胞。
(6)可使全血肌酐、血漿尿素及遊離氨基酸含量下降，對預防腎功衰竭有一定作用。
(7)保護胃黏膜，促進小腸運動，提高蛋白酶和澱粉酶的活性，有利於食物的消化、溶解，減輕應急性胃潰瘍病變的程度。
(8)磁化水的抗衰老效應。人體的衰老主要是體內蛋白質的緩慢變性所致，磁化水通過穩定蛋白質上的電荷及其表面的水化層來減慢其變性過程，另外磁處理水還使某些生化反應加快，這就減慢衰老過程，因此，磁化水具有抗衰老的作用。
(9)磁化水的毒性。經試驗研究及臨床觀察，長期飲用磁處理水沒有副作用。
