磁共振是八十年代開始應用的先進的影像診斷設備。它的工作原理是利用磁場和無線電波將人體各組織的形態在熒光屏上顯示出來。它所獲得的圖像異常清晰、精細，使醫生如同直接看到了人體內部組織那樣清晰、明瞭，大大提高了診斷效率，避免了許多剖胸或剖腹探查診斷的手術。它不使用對人體有害的X線和易引起過敏反應的造影劑，不但可以做橫斷層掃描，還可以做冠狀面與矢狀面斷層，這樣可更精確判斷疾病的部位。磁共振應用的範圍很廣，對顱腦、脊髓等疾病是當今最有效的影像診斷方法。可早期發現腫瘤、腦梗塞、腦出血、腦膿腫、腦囊蟲症及先天性腦血管畸形，還可確定腦積水的種類及原因。磁共振在顯示脊髓先天異常、脊髓空洞症及硬化症、椎管瘢痕等均有獨到之處。
磁共振成像在顯示椎間盤脫出、退行性病變等也是非常清晰，椎間盤脫出壓迫神經根也可顯示得一清二楚。磁共振可勾劃輪廓清晰的心臟各房、室間隔，心瓣膜及心肌的圖像。因此，先天性心臟病及各種心肌病均是磁共振檢查的適應症。
磁共振也可用於檢查子宮、卵巢、膀胱及前列腺的腫瘤，並可對癌腫進行分期，對肝臟、胰腺等的腫瘤也可清楚的顯示出來。
磁共振檢查沒有放射損害，對顱腦、肝膽、肺、盆腔、骨骼、四肢，以及血液等各種疾病均能準確檢查診斷，特別是對小腦、脊髓等CT無法確診的疾病，磁共振都能清楚顯示，準確診斷。由於磁共振的多方位成像對病變定位，所以定量診斷更準確。準確率達95%。
