膽瘻：膽瘻是膽管癌術後最常見的併發症，多發生肝葉切除肝創面膽管處理不當或肝內膽管分別與空腸吻合，因肝內膽管開口眾多，有時難以處理妥善，改用膽管成型後與空腸吻合，膽汁瘻發生減少;亦可發生於經肝引流管穿出肝表面處。
腹腔大出血：多發生於合併肝葉切除及術中門靜脈損傷者，亦見於膽腸吻合口出血，腹腔引流鮮血>200ml/h，提示腹腔內有活動性出血。急診手術止血。預防以術中確切縫合止血為主。
肝功能衰竭：肝功能衰竭是膽管癌手術期死亡常見原因，多見於肝臟儲備功能差的患者。預防包括結合術前肝功能評測，正確判定手術切除範圍，積極進行圍手術期保肝治療，儘可能避免使用對肝腎功能損害大的藥物。
急性腎功能衰竭：多繼發於重度黃疸。常因有效循環血容量不足，交感神經興奮、腎素血管緊張素系統活動增強、腎前列腺素減少，血栓素A2增加及內毒素血癥所致。特徵為自發性少尿或無尿、氮質血癥、稀釋性低鈉血癥和低尿鈉。
應激性潰瘍出血：重症梗阻性黃疸病人術後嚴重併發症。其發病機制尚未完全明瞭，一般認為高膽紅素血癥、高膽鹽血癥破壞胃粘膜屏障，減少胃粘膜血流有關。同時患者常合併感染、敗血症、營養不良等，手術創傷大均可導致胃粘膜低灌注形成粘膜潰瘍出血，嚴重者可出現穿孔。
