正常情況下，通過鼻腔呼吸的氣流是沿鼻中隔以層流的形式進入。鼻中隔偏曲患者的鼻腔結構改變、畸形，氣流進入鼻腔形成漩渦，氣流擾亂，使得變應原積聚，濃度增高，滯留時間延長。鼻中隔偏曲的突起部更易更多受到氣流的衝擊，噴嚏反射弧的敏感性增高。此外，過敏性鼻炎的發病除了抗原抗體反應外，還與植物神經系統有關，雙側鼻腔長期不均勻刺激，很容易導致鼻腔副交感神經的興奮性增高。糾正鼻內解剖結構異常，去除鼻中隔偏曲的因素後，解除了鼻道不同程度的阻塞。
當呼吸氣流順暢，可以減輕鼻腔黏膜的炎症及鼻腔黏膜腺體分泌和血管神經反應性，減少了嗜酸性粒細胞及嗜鹼性細胞的分泌，緩解炎症性鼻黏膜水腫和血管擴張，從而使臨床症狀得以緩解。因此，伴有鼻中隔偏曲的過敏性鼻炎患者的手術治療療效要明顯優於未行手術治療的療效；而同樣行手術治療，伴有鼻中隔偏曲的過敏性鼻炎患者的遠期療效優於不伴有鼻中隔偏曲的過敏性鼻炎患者。
在手術過程中破壞篩前神經副交感纖維和鼻黏膜神經末梢，也降低了鼻黏膜的反應性阻滯過度興奮的副交感神經對血管和腺體的作用，對提高療效有一定的作用。
