葡萄球菌抗原構造複雜，已發現的在30種以上，其化學組成及生物學活性瞭解的僅少數幾種。
葡萄球菌A蛋白 1.葡萄球菌A蛋白(Staphylococcal protein A,SPA)存在於菌細胞壁的一種表面蛋白，位於菌體表面，與胞壁的粘肽相結合。它與人及多種哺乳動物血清中的lgG的 Fc 段結合，因而可用含SPA的葡萄球菌作為載體，結合特異性抗體，進行協同凝集試驗。A蛋白有抗吞噬作用，還有激活補體替代途等活性。SPA是一種單鏈多肽，與細胞壁肽聚糖呈共價結合，是完全抗原，具屬特異性。
2.多糖抗原 具有群特異性，存在於細胞壁，藉此可以分群，A群多糖抗原體化學組成為磷壁酸中的N-乙酰葡胺核糖醇殘基。B群化學組成是磷壁酸中的N-乙酰區糖胺甘油殘基。
3.莢膜抗原 幾乎所有金黃色葡萄球菌菌株的表面有莢膜多糖抗原的存在。表皮葡萄球菌僅個別是菌株有此抗原。
