1、隔離傳染源
對本病患者進行嚴格的呼吸道隔離是預防的重要環節。隔離期為發病後7周；或痙攣性咳嗽發病後4周。易感兒童的密切接觸者（特別是在集體機構）需要隔離3周。應特別注意的是，成年患者需要避免與兒童接觸。如果家庭成員有咳嗽和呼吸困難等症狀，在照顧幼兒時必須戴上口罩，家裡需要經常通風並進行清潔和消毒。
2.規範計劃性疫苗接種
這是保護易感人群的基本措施。疫苗有2種類型：全細胞DTP疫苗和無細胞DTP疫苗。目前，國內大多數疫苗採用全細胞疫苗（一類疫苗，免費），對3至6個月大的嬰兒進行三次皮下注射，進行基礎免疫。在流行期，1個月大的兒童可以接種疫苗。重點是全面免疫，隨後根據需要進行強化免疫。全細胞百日咳疫苗是有效的，但還不夠有效，兒童和成人在免疫後再次感染百日咳的情況屢有報道。無細胞百日咳疫苗比全細胞疫苗有更好的保護效果，並且避免了全細胞疫苗的副作用。因此，北京市以無細胞白喉疫苗取代全細胞白喉疫苗作為第一類疫苗（免費）。
