在確診腎絞痛後，醫生會根據患者就診時的疼痛程度，伴隨症狀如噁心、嘔吐以及對止痛藥物的反應做相應治療。治療用藥一般有個梯度：
①疼痛能耐受或腎絞痛後餘痛，可選擇口服止痛劑和解痙藥物。
②疼痛難以耐受，就應肌肉注射阿托品(解痙藥物)，一般15—20分鐘起作用，但有口乾、心跳加速等副作用。
③疼痛劇烈或肌注阿托品20分鐘後疼痛仍末緩解者，通常需要注射毒麻類藥物如杜冷丁或嗎啡，其止痛作用強，同時有鎮靜作用，肌注後15—20分鐘顯效，可維持4—6小時。但不宜多次使用，以免成癮。④如經上述處理疼痛仍未緩解，就需要靜脈輸液了。有少數頑固的腎絞痛患者，短時間內對各種止痛劑都不敏感，只能在藥效的作用下慢慢緩解。
腎絞痛並非獨立的一種疾病，而是一種症狀。就發病規律而言，腎絞痛伴有血尿，大多由腎與輸尿管結石引起，但這不是結石所特有的症狀。因此腎絞痛發作緩解後，必須進一步檢查病因做相應的治療，否則可能存在以下兩大危險：
首先，不能及時發現尿路梗阻。腎絞痛最常見的原因是尿路結石，有時結石在腎盂或輸尿管中嵌頓，不一定出現絞痛，但可以引起梗阻，導致不同程度的腎積水。久而久之，腎積水可以日益加重，最後導致腎功能喪失。在此過程中，患者僅有輕微腰痠或沒有明顯的症狀，容易被忽視。有人把腎臟比做“啞巴”器官，意思是自身有了較嚴重的病變，卻沒有明顯反應，這也是腎絞痛容易被忽視的主要原因。
其次，可能延誤腎腫瘤、結核等重要疾病的診斷。任何原因的腎出血，如形成血塊通過輸尿管時，都會刺激輸尿管而發生痙攣，造成梗阻，出現像腎結石一樣的絞痛。因此，腎絞痛後腹部X線拍片看不到結石，不等於就沒有問題。
凡有過腎絞痛發作者，應經常化驗小便，如發現有血尿，即使無絞痛發作，也說明病變仍存在。必要時，可做B超、靜脈腎盂造影等檢查。
