一、體質因素
本病主要發生在嬰幼兒，其內因特點：
(1)嬰兒胃腸道發育不夠成熟，酶的活性較低，但營養需要相對地多，胃腸道負擔重。
(2)嬰兒時期神經、內分泌、循環系統及肝、腎功能發育均未成熟，調節機能較差。
(3)嬰兒免疫功能也不完善。血清大腸桿菌抗體滴度以初生至2週歲最低，以後漸升高。因而嬰幼兒易患大腸桿菌腸炎。母乳中大腸桿菌抗體滴度高，特別是初乳中致病性大腸桿菌分泌型IgA高，所以母乳餵養兒較少發病，患病也較輕。同理小嬰兒輪狀病毒抗體低，同一集體流行時，小嬰兒罹病多。
(4)嬰兒體液分佈和成人不同，細胞外液佔比例較高，且水分代謝旺盛，調節功能又差，較易發生體液、電解質紊亂。嬰兒易患佝僂病和營養不良，易致消化功能紊亂，此時腸道分泌型IgA不足，腹瀉後易於遷延。
二、感染因素
在我國小兒腹瀉是居第二位的小兒常見多發病，發病年齡多在2歲以下，每年有一兩次發病高峰，一為6、7、8月，主要病原是埃希氏大腸桿菌與痢疾桿菌;二為10、11、12月，稱秋季腹瀉，主要病原是輪狀病毒。分為消化道內與消化道外感染，以前者為主。
(1)消化道內感染：致病微生物可隨汙染的食物或水進入小兒消化道，因而易發生在人工餵養兒。哺餵時所用器皿或食物本身如未經消毒或消毒不夠，亦有感染可能。病毒也可通過呼吸道或水源感染。其次是由成人帶菌(毒)者的傳染，如病房內暴發細菌性(或病毒性)腸炎後部分醫護人員受染，成為無症狀腸道帶菌(毒)者，可導致病原傳播。寒冷季節的嬰幼兒腹瀉80%是病毒感染引起。病毒性腸炎主要病原為輪狀病毒。
