全身性原因(40%)：
1、過敏反應：如果食用刺激性的食物，如辣椒、芥末、香料、酒或特異性蛋白質食物，也有服用某些y物，如抗生素等均可因過敏而引起肛門瘙癢。
2、寄生蟲病：如蛻蟲、蛔蟲、陰道滴蟲、陰蝨、疥瘡等，均可引起肛門瘙癢。
3、內分泌和代謝性疾病：如糖尿病患者皮膚含糖量增高，刺激神經末梢所致瘙癢;甲狀腺功能亢進症皮膚瘙癢，可能與多汗、基礎代謝率增高、情緒緊張等有關。
4、血液病：缺鐵性貧血等。
5、胃腸疾病：急慢性腹瀉、便秘、胃腸神經官能症等。
局部性因素(40%)：
1、皮膚病變：肛門皮膚病如肛門溼疹、神經性皮炎、癬、各種疣、性病、汗腺炎等，糞便附於肛門皺襞內，刺激皮膚而引起瘙癢。
2、肛門周圍微生物：如蟯蟲寄生常是兒童肛門瘙癢的常見原因，這種肛門瘙癢，經過驅蟲治療，襯褲勤換勤洗等衛生措施，即可治癒。
3、肛門直腸疾病：如肛裂、肛瘻、痔、肛竇炎、肛乳頭炎、直腸脫垂、肛門失禁等，使肛門口分泌物增多，陰道炎分泌物刺激等潮溼刺激皮膚引起瘙癢。
遺傳(10%)：
與家族遺傳因素有關係。
