治療黴菌性陰道炎可以採用單純西藥治療法，也可以用中西醫結合治療。
(1)一般治療：黴菌性陰道炎可以採用小蘇打水清洗外陰，制黴菌素陰道栓治療，內服酮康唑，克黴唑。內褲每日更換並且洗淨煮沸消毒 。治療一療程後，如果黴菌檢查為陰性，之後每次月經週期後複查黴菌為陰性，連續鞏固治療三個療程才算治癒。積極治療可以引起黴菌性陰道炎的其他疾病，消除易感因素。保持外陰清潔乾燥，避免搔抓。治療期間禁止性生活。不宜食用辛辣刺激性食品。
(2)改變陰道酸鹼度：念珠菌生長最適宜的pH值為5.5，因此採用鹼性溶液沖洗外陰、陰道，改變陰道的酸鹼度，對黴菌的生長繁殖會有抑制作用。可使用2%～4%的小蘇打水沖洗陰道，每日1～2次，2周為1療程。沖洗後要拭乾外陰，保持外陰乾燥，以抑制念珠菌的生長。
(3)陰道上藥：使用咪唑類栓劑陰道上藥，對黴菌性陰道炎有很好的療效。克黴唑栓每晚1粒，於沖洗後納入陰道，10～14天為1療程;或達克寧栓每晚1粒，沖洗後陰道上藥，7天為1療程。
(4)外用藥膏：使用克黴唑軟膏或達克寧軟膏外塗，可以治療因黴菌感染引起的外陰炎，減輕外陰癢痛的症狀。每日外塗數次，應用2周。益膚清軟膏是以益康唑為主藥，加有少量局部類固醇治療劑製成，止癢效果良好，對患黴菌性外陰炎、陰道炎外陰癢痛難耐者更適合。外塗外陰，早晚各1次。
(5)口服用藥：由於黴菌感染可以通過性生活在夫妻間相互傳染，因此可以通過口服用藥對雙方進行治療，口服藥同樣可以抑制腸道念珠菌。氟康唑口服：一次 150毫克，頓服。或斯皮仁諾口服：如為初次感染念珠菌陰道炎，每次服200毫克，於早、晚飯後服用，僅服1天;如為複發性黴菌性陰道炎，斯皮仁諾藥量需加大，可每次服200毫克，每日1次，連服3天，也可每日服2次，每次100毫克，連服3天。服藥均在飯後。
應用上述方法治療後，患者的臨床症狀會很快得到改善，但這並不能肯定黴菌性陰道炎已經痊癒，患者應該堅持完成治療療程，然後到醫院複查症狀，做婦科檢查並化驗陰道分泌物，如果都無異常，說明近期治癒。以後每月月經乾淨後還要到醫院複查1次上述檢查內容，連續3個月，如果都為陰性，才是徹底治癒。
