1、子宮原因。也叫子宮性閉經。女人不來例假的原因是因子宮有問題而引起的閉經，例如先天性無子宮、子宮發育不良，或兒童期間疾病累及子宮內膜，發生了粘連或瘢痕，雖然卵巢功能很好，女性特徵發育正常，但無月經。出現月經初潮以後患病，例如子宮內膜結核、子宮內膜血吸蟲病、子宮內膜化膿或刮宮時刮掉了子宮內膜基底層時，不能對卵巢激素髮生反應而發生繼發性閉經。
2、卵巢原因。也稱卵巢性閉經。正常月經的發生，女人不來例假的原因是由於卵巢分泌的激素作用於子宮內膜，使之發生變化，然後脫落、出血而形成。如果卵巢 不能分泌激素，則子宮內膜不發生變化，月經將自然停止，例如先天性卵巢發育不良、卵巢早衰等。這種原因的閉經，常伴有女性特徵退化現象，如乳房變平等。
3、垂體原因。稱垂體性閉經。腦垂體位於大腦的下方，體積很小，但統帥著全身的內分泌器官，當垂體功能變化時，卵巢功能降低。常見的腦垂體病變是腫瘤和垂體功能低下症。
4、中樞神經系統原因。中樞神經系統包括大腦和下丘腦，它們統帥著腦垂體的活動，間接控制卵巢功能。當中樞神經受刺激時，卵巢功能變化而引起閉經。如失戀、喪失親人、工作失敗時，可以突然閉經，下丘腦腫瘤也會引起閉經。
5、其他原因。這一類包括的範圍更廣，例如患全身性疾病、內分泌疾病，化療期間，急劇消瘦以及患多囊卵巢綜合徵等。
