1.外用藥物可以給與2%酮康唑洗劑外用,連續使用7~10天;2%二硫化硒洗劑外用,7~19天。面積較小的患者,或由於各種原因不能口服抗真菌藥物的患者,可以給予1%聯苯苄唑乳膏/凝膠、2%咪康唑乳膏、2%酮康唑乳膏、2%益康唑乳膏,療效均較好。
特比萘芬、布替萘芬、萘替芬等丙烯胺類抗真菌藥物同樣有效。阿莫羅芬和環吡酮胺作為新型抗真菌藥物,也可以應用於花斑糠疹的治療。由於花斑糠疹難以治癒,容易復發,間歇重複用藥以保證感染的根除,有的時候還可以先用洗劑清洗後再外用藥物,能提高療效。
2.系統治療對於面積較大或者反覆發作的患者,可以給予伊曲康唑,酮康唑,氟康唑等唑類藥物口服治療。注意口服灰黃黴素和特比萘芬對花斑糠疹療效差,不用於治療花斑糠疹。