一、乙腦是蚊蟲傳染的，滅蚊是預防乙腦最根本、最有效的辦法。除了消滅蚊子外，還防止蚊子叮咬，如裝紗門、紗窗。睡覺的時候，可以掛上蚊帳或點上蚊香，另外，在乙腦流行期間，晚上最好不要讓孩子光背在外面睡覺，以減少傳染的機會。
10歲以下兒童應在4～5月份開始接受流行性乙型腦炎疫苗注射。據上海市傳染病院統計，凡注射了疫苗的一般都不發病，即使發病也很輕。所以家長不應忽視按時給孩子注射乙腦預防針。
二是、做好疫苗預防接種這是預防與控制乙腦最經濟、有效的措施。我國乙腦病例中10歲以下兒童佔80%以上，5歲以下佔50%。一般要求1歲接種2次，2歲加種1次，5歲再加種1次，共4次，若有遺漏者應去地區衛生服務中心補種，外來人口中有遺漏接種者也應去補種。
三是、加強動物傳染源管理，搞好家禽、家畜棚舍的環境衛生。
四是、搞好預防接種，及時注射乙腦疫苗。注射乙腦疫苗效果明顯，保護率高。流行地區接種對象一般為6個月以上、10歲以下的兒童。乙腦滅活疫苗第一年需注射2次，間隔7～10天，以後每年加強一次;減毒活疫苗不分初免，每年一針至6歲，可獲得持久免疫力。注射劑量為6～12個月嬰兒0.25毫升;1～6歲0.5毫升;7～15歲1毫升;16歲以上每次2毫升。因為疫苗接種後，大約40天左右才產生免疫力，所以一定要提前接種。在乙腦流行季節，用大青葉、板蘭根、銀花各15克水煎服，每日1劑，連服7天，有預防作用。平時要注意增強孩子的體質，提高抗病能力。同時，普及乙腦的防病知識，及時發現病人，早隔離，早診斷，早治療，儘量減少乙腦對人類健康的危害。
