肝小三陽的發生和發展與機體免疫功能受損有重大關聯。主要是由於免疫系統的缺陷為病毒大量複製提供機會，並最終發展為慢性病，而我國乙肝小三陽患者大多是嬰幼兒期感染的。乙肝小三陽的主要病因是：
1、小時候感染乙肝病毒：臨床數據顯示，嬰幼兒時期感染乙肝病毒的患者發展為乙肝小三陽的幾率非常大，佔感染者的90%左右。
2、家庭的垂直傳播：包括母嬰垂直傳播和父嬰垂直傳播的兩種形式，尤其以母嬰垂直傳播居多。
3、不注意預防：據調查數據顯示我國乙肝疫苗的接種工作始終開展得不夠理想，到現在也只有不到一半的人口接種過乙肝疫苗。這就使得對乙肝的預防難以奏效，慢性病例越來越多。
4、漏診、誤診：這主要是乙肝症狀具有非常強的隱匿性，並且無特異性造成的。如果有興趣進一步瞭解的話，可以在線諮詢肝病專家。
5、季節變化：小三陽發作的季節各不相同，春、夏兩季為肝炎容易發作季節，秋冬季發作者相對較少，四季肝功波動的概率分別是：春季波動者約佔22.94%，夏季佔23.85%，秋季佔9.17%，冬季佔18.34%。
6、變更環境：小三陽患者在病情平穩後不久，就改變原有的生活習慣和生活環境，如出差、旅行等，因生活環境、水土條件變更，造成體內環境紊亂而出現肝功異常。誘發小三陽的常見病因?
7、誤服或濫用藥物也是導致小三陽的病因：一些小三陽患者往往求治心切，亂服用各種自制中Y製劑;有的長期服用"偏方"、"驗方"，有的用藥不符合適應症，有的重複大量使用所謂保肝藥;有的誤認為中藥沒有毒副作用，不加選擇隨便使用。肝臟在這些零亂、複雜的Y物形成的化學反應的影響下，炎症和中毒情況越來越重，肝功損害日見加重。誘發小三陽的常見病因?
8、過度勞累：過度勞累會破壞人機體相對平衡的免疫狀況，促使小三陽病毒複製加劇，肝臟的負擔加重，導致肝炎復發。過度勞累的情況有以下幾種：長途跋涉、熬夜、精神高度緊張、工作壓力過大、情緒波動、暴怒和鬥毆以及房事過頻等等。
