射精過程是在神經支配下，由生殖器官(主要是輸精管、射精管、陰囊等)、盆底肌肉、尿道以及尿道周圍的肌肉的節律性協同收縮而完成的，這些部位的功能和結構異常，均可在射精過程中出現不舒服的感覺或隱痛，嚴重者可以表現為明顯的疼痛不適。
造成射精疼痛的病因包括如下3個方面：
(1)心理因素
緊張、焦慮、抑鬱等不良心理因素，常見於神經過敏、情緒不穩定以及神經官能症患者，他們性器官的敏感性很高，性活動可以造成局部肌肉的痙攣性收縮，因此而出現射精疼痛。
(2)性交頻度和強度異常
性交頻度過高的男性，由於性器官的過度工作而得不到必要的休整，可引起射精疼痛;性交動作過於猛烈，尤其是長時間沒有性生活的男性突然恢復性交後，特別容易出現粗暴的性行為而誘發射精疼痛;過分乾燥的性器官在性交的時候缺乏潤滑作用而容易誘發射精疼痛。
(3)疾病因素
一些泌尿生殖系統疾病可以導致射精疼痛，主要包括炎症(前列腺炎、精囊炎、包皮龜頭炎、精索炎、睪丸附睪炎、膀胱尿道炎等)、結(輸尿管結石、膀胱結石、尿道結石、精囊結石、前列腺結石等)、生殖器官腫瘤和其他疾病，例如尿道狹窄、陰莖硬結症等。
一旦出現射精疼痛，不要過於緊張、焦慮和恐懼，應該首先自我分析一下疼痛不適的程度和持續時間。，一般情況下，輕微短暫的疼痛不適，往往屬於性交因素或心理因素，可以進行自我調整，例如停止性交幾日、避免性交動作的激烈和粗暴、節制性交次數、性交時使用潤滑劑等，還可以進行心理疏導，例如消除患者的緊張焦慮情緒、克服不良的精神心理因素，也可以明顯緩解或消除射精疼痛症狀;在自我調整無效的情況下，應接受醫生的診治。如果疼痛持續的時間比較長，且疼痛的程度很重，可能存在器質性疾病，或者可能病變比較嚴重，應該儘早尋求醫療幫助，在去除原發疾病後，多數患者基本可以恢復無痛的射精。
