感染源是那些體內有病原體生存和繁殖並能排洩的動物和人類。禽流感的主要傳染源是患病和帶毒的鳥類，包括水禽和猛禽。研究表明，對於高致病性禽流感來說，一克被汙染的糞便所含的病毒足以導致一百萬只鳥的感染。目前還不能將人類視為禽流感的感染源。
對某一特定傳染病易感的動物被稱為易感動物。各種鳥類都容易感染禽流感，包括雞、火雞、鴨、鵝、鵪鶉、野雞、鷓鴣、鴕鳥、鴿子和孔雀。最易感染的是雞和火雞，而鴨子、鵝和其他水禽大多是隱性感染的。水禽與同一農場的幹鳥混養會造成交叉感染，病毒很容易在大量餵養的雞群或鴨群中傳播。野生和養殖的水禽可以通過使用共同的水體進行傳播。除了感染鳥類之外，禽流感還可以感染豬。
