對於子宮內膜不典型增生的治療，首先要明確診斷，查清原因，若伴有多囊卵巢、卵巢功能性腫瘤、其他內分泌功能紊亂，應行針對性治療。同時對診斷為子宮內膜不典型增生者即刻開始對症治療，採用藥物治療或手術治療。方案的選擇應根據患者的年齡、對生育的要求，以及身體健康情況等確定。年齡小於40歲者，其癌變傾向低，可首先考慮藥物治療。年輕而盼望生育者，更應先試用藥物治療，因藥物治療後約30%患者仍有可能受孕並足月分娩。對於絕經前後的婦女，癌變的潛在趨勢高於年輕者，故多直接採取子宮切除。
1.藥物治療原則為
規範用藥、長期檢查、定期檢測、及時助孕。用藥種類：①促排卵藥物氯米芬，每天一次，週期第5-9天服用，必要時用藥期可延長2-3天。②孕激素類藥物：根據內膜不典型程度不同而有區別，輕度不典型增生可以黃體酮肌注，週期第18天或第20天開始，共用藥5-7天。中度及重度不典型增生者連續性應用甲羥孕酮，以3個月為一個療程，每完成一個療程即刮宮或取子宮內膜組織作組織學檢查，根據對藥物的反應，選擇停止治療或對藥物的劑量酌情增減。亦可宮腔內放環。
2.手術治療
刮宮吸宮術不僅是重要的診斷方法，也是治療手段之一。因為局部病灶通過刮宮亦有被清除的可能。年齡在40歲以上，無生育要求的子宮內膜不典型增生患者，一經診斷即可行子宮切除。但對於高血壓、糖尿病、肥胖或高齡而對於手術耐受力差者，也可考慮在嚴密隨診檢測下先試用藥物治療。年輕患者經藥物治療無效，內膜持續增生或加重或懷疑已發展為癌，或陰道出血不能為刮宮及藥物治療所控制及產後復發者，均可考慮手術切除子宮。
