咽炎和扁桃體炎同樣會引起咽乾、咽喉部異物感、咽痛等，相同的症狀時常讓人區分不清楚。為了得到正確的治療，如何區分它們顯得很重要。
由以下2個方面來區分咽炎和扁桃體炎
發病部位
咽炎發生在咽部及其喉部的咽粘膜、粘膜下組織及其淋巴組織;
扁桃體炎則發生在扁桃體的粘膜下組織、隱窩、實質。
雖說咽部和扁桃體這兩個部位捱得很近，但可以通過看圖片來區分。
臨床表現
咽炎與扁桃體炎都可分為急性和慢性，急性咽炎常見成年人群，以咽乾發熱，咽部疼痛為主要症狀，疼痛加重時會有放射耳通;急性扁桃體炎好發於兒童，以咽痛，有異物感，發燒為主要症狀。慢性炎症都是急性炎症反覆發作導致的，病症比之前加重，還可能會有其他併發症。
張開嘴若看見扁桃體充血、腫大，甚至有黃白色膿點附著，此為扁桃體炎的典型症狀;若充血、水腫是以咽壁黏膜為主，或咽紅、咽後壁淋巴濾泡增生，這便是咽炎的臨床表現。
比較直接的區別為扁桃體炎會出現扁桃體腫大及發燒症狀，體溫可達39～40℃。
